در سالهای اخیر با افزایش بنگاههای تولیدی و خدماتی، رقابت این بنگاه ها رو به افزایش گذشته است و با توجه به محدودیت ها و هزینه بالای منابع لزوم کاهش قیمت تمام شده به منظور داشتن توان بالقوه رقابتی در بازارها اصلی ترین دغدغه مدیران در حال حاضر می باشد. دراین میان بهره وری نقش بسزایی در کمک به سازمانها ایفا می کند و معیاری است که به کمک آن می توان به طور مداوم شرایط موجود را بهبود بخشید که این از وظایف مدیران محسوب می شود. اندازه گیری جزء عناصر اصلی چرخه بهره وری می باشد و نقش محوری را در بهبود بهره وری ایفا می کند. در این میان مدل تحلیل پوشش داده ها یکی از ابزارهای مناسب سنجش بهره وری معرفی شده است. در این مقاله برای ارزیای عملکرد بیمارستانها و سیستم های خدمات درمانی مدل جامعی با استفاده از مدل تحلیل پوششی داده ها (DEA) به عنوان واحدهای تصمیم گیرنده (DMU) معرفی میگردد. به منظور یافتن مناسب ترین مدل از مدلهای پایه ای DEA همانند BCC , CCR بر اساس دو عامل واقع بینانه بودن و سنجش استفاده می گردد . در انتها نیز مطالعه موردی که در تعدادی ازبیمارستانهای کشور به انجام رسیده است بیان می گردد.